| 順位 | 市町村名 | 総合・事業所数(2016)データ |
| 1 | 熊本市 | 1,822 |
| 2 | 八代市 | 347 |
| 3 | 天草市 | 193 |
| 4 | 玉名市 | 99 |
| 5 | 宇城市 | 80 |
| 5 | 菊陽町 | 80 |
| 7 | 山鹿市 | 79 |
| 8 | 人吉市 | 78 |
| 9 | 菊池市 | 63 |
| 10 | 益城町 | 60 |
| 11 | 合志市 | 58 |
| 12 | 宇土市 | 54 |
| 13 | 大津町 | 52 |
| 14 | 上天草市 | 51 |
| 15 | 水俣市 | 48 |
| 16 | 荒尾市 | 47 |
| 17 | 阿蘇市 | 40 |
| 18 | 嘉島町 | 33 |
| 19 | 御船町 | 29 |
| 20 | 芦北町 | 24 |
| 21 | あさぎり町 | 21 |
| 22 | 長洲町 | 20 |
| 22 | 山都町 | 20 |
| 24 | 和水町 | 19 |
| 25 | 錦町 | 17 |
| 25 | 多良木町 | 17 |
| 27 | 小国町 | 15 |
| 27 | 甲佐町 | 15 |
| 27 | 氷川町 | 15 |
| 30 | 西原村 | 12 |
| 31 | 南関町 | 11 |
| 32 | 美里町 | 8 |
| 33 | 玉東町 | 7 |
| 33 | 南阿蘇村 | 7 |
| 35 | 高森町 | 5 |
| 35 | 相良村 | 5 |
| 37 | 津奈木町 | 4 |
| 37 | 苓北町 | 4 |
| 39 | 南小国町 | 3 |
| 39 | 湯前町 | 3 |
| 39 | 山江村 | 3 |
| 42 | 産山村 | 2 |
| 42 | 水上村 | 2 |
| 42 | 五木村 | 2 |
| 45 | 球磨村 | 1 |