| 順位 | 市町村名 | 畜産産出額・小計[千万円]データ |
| 1 | 菊池市 | 1,941 |
| 2 | 熊本市 | 765 |
| 3 | 阿蘇市 | 545 |
| 4 | 合志市 | 473 |
| 5 | 山鹿市 | 432 |
| 6 | 大津町 | 418 |
| 7 | 錦町 | 353 |
| 8 | 天草市 | 335 |
| 9 | あさぎり町 | 261 |
| 10 | 西原村 | 254 |
| 11 | 人吉市 | 239 |
| 12 | 和水町 | 214 |
| 13 | 山都町 | 199 |
| 14 | 南小国町 | 195 |
| 15 | 玉名市 | 177 |
| 16 | 相良村 | 175 |
| 17 | 宇城市 | 174 |
| 18 | 菊陽町 | 146 |
| 19 | 産山村 | 130 |
| 20 | 芦北町 | 123 |
| 21 | 高森町 | 115 |
| 22 | 御船町 | 110 |
| 23 | 小国町 | 104 |
| 24 | 多良木町 | 94 |
| 25 | 南関町 | 84 |
| 26 | 益城町 | 76 |
| 27 | 南阿蘇村 | 74 |
| 28 | 荒尾市 | 73 |
| 29 | 美里町 | 72 |
| 30 | 水俣市 | 59 |
| 31 | 上天草市 | 52 |
| 32 | 甲佐町 | 44 |
| 32 | 氷川町 | 44 |
| 34 | 苓北町 | 40 |
| 35 | 湯前町 | 36 |
| 36 | 八代市 | 27 |
| 37 | 嘉島町 | 16 |
| 38 | 水上村 | 14 |
| 39 | 宇土市 | 13 |
| 39 | 山江村 | 13 |
| 41 | 玉東町 | 10 |
| 41 | 津奈木町 | 10 |
| 43 | 球磨村 | 6 |
| 44 | 長洲町 | 2 |