| 順位 | 市町村名 | 耕種産出額・小計[千万円](2018)データ |
| 1 | 熊本市 | 4,016 |
| 2 | 八代市 | 3,338 |
| 3 | 玉名市 | 2,064 |
| 4 | 宇城市 | 1,697 |
| 5 | 山鹿市 | 1,268 |
| 6 | 菊池市 | 909 |
| 7 | 山都町 | 735 |
| 8 | 阿蘇市 | 658 |
| 9 | 天草市 | 622 |
| 10 | 氷川町 | 602 |
| 11 | 益城町 | 542 |
| 12 | あさぎり町 | 452 |
| 13 | 宇土市 | 427 |
| 14 | 南阿蘇村 | 333 |
| 15 | 合志市 | 318 |
| 16 | 和水町 | 302 |
| 17 | 玉東町 | 284 |
| 18 | 大津町 | 257 |
| 19 | 多良木町 | 243 |
| 20 | 甲佐町 | 228 |
| 21 | 菊陽町 | 218 |
| 22 | 錦町 | 210 |
| 23 | 芦北町 | 207 |
| 24 | 上天草市 | 197 |
| 25 | 御船町 | 173 |
| 26 | 高森町 | 168 |
| 27 | 荒尾市 | 167 |
| 28 | 人吉市 | 154 |
| 29 | 西原村 | 143 |
| 30 | 南関町 | 138 |
| 31 | 美里町 | 131 |
| 32 | 小国町 | 122 |
| 33 | 苓北町 | 112 |
| 34 | 相良村 | 102 |
| 35 | 水俣市 | 98 |
| 36 | 湯前町 | 90 |
| 37 | 長洲町 | 89 |
| 38 | 嘉島町 | 83 |
| 39 | 産山村 | 75 |
| 40 | 南小国町 | 74 |
| 41 | 津奈木町 | 60 |
| 42 | 球磨村 | 42 |
| 43 | 水上村 | 39 |
| 43 | 山江村 | 39 |
| 45 | 五木村 | 3 |