| 順位 | 市町村名 | その他・事業所数(2016)データ |
| 1 | 熊本市 | 1,503 |
| 2 | 天草市 | 400 |
| 3 | 八代市 | 397 |
| 4 | 玉名市 | 207 |
| 5 | 宇城市 | 165 |
| 6 | 人吉市 | 150 |
| 6 | 山鹿市 | 150 |
| 8 | 荒尾市 | 132 |
| 9 | 菊池市 | 111 |
| 10 | 上天草市 | 105 |
| 10 | 阿蘇市 | 105 |
| 12 | 菊陽町 | 91 |
| 13 | 宇土市 | 86 |
| 14 | 水俣市 | 85 |
| 15 | 合志市 | 81 |
| 16 | 大津町 | 60 |
| 17 | 芦北町 | 59 |
| 18 | あさぎり町 | 57 |
| 19 | 山都町 | 55 |
| 20 | 嘉島町 | 48 |
| 21 | 多良木町 | 40 |
| 21 | 苓北町 | 40 |
| 23 | 小国町 | 39 |
| 24 | 長洲町 | 38 |
| 24 | 高森町 | 38 |
| 26 | 御船町 | 35 |
| 27 | 美里町 | 34 |
| 27 | 錦町 | 34 |
| 29 | 南関町 | 33 |
| 30 | 和水町 | 31 |
| 31 | 益城町 | 28 |
| 32 | 氷川町 | 26 |
| 33 | 甲佐町 | 25 |
| 34 | 南小国町 | 22 |
| 34 | 南阿蘇村 | 22 |
| 34 | 湯前町 | 22 |
| 37 | 西原村 | 21 |
| 38 | 相良村 | 10 |
| 38 | 球磨村 | 10 |
| 40 | 玉東町 | 9 |
| 40 | 津奈木町 | 9 |
| 42 | 産山村 | 7 |
| 43 | 水上村 | 6 |
| 43 | 山江村 | 6 |
| 45 | 五木村 | 2 |