| 順位 | 市町村名 | 耕種産出額・小計[千万円](2018)データ |
| 1 | 雲仙市 | 1,666 |
| 2 | 南島原市 | 1,434 |
| 3 | 諫早市 | 1,203 |
| 4 | 島原市 | 897 |
| 5 | 佐世保市 | 702 |
| 6 | 西海市 | 562 |
| 7 | 長崎市 | 484 |
| 8 | 五島市 | 430 |
| 9 | 大村市 | 395 |
| 10 | 平戸市 | 290 |
| 11 | 壱岐市 | 280 |
| 12 | 長与町 | 269 |
| 13 | 松浦市 | 212 |
| 14 | 東彼杵町 | 157 |
| 15 | 川棚町 | 79 |
| 16 | 波佐見町 | 75 |
| 17 | 時津町 | 64 |
| 18 | 対馬市 | 60 |
| 19 | 佐々町 | 45 |
| 20 | 小値賀町 | 23 |
| 21 | 新上五島町 | 8 |