| 順位 | 市町村名 | 医療(2016-2017)=薬剤師数[人](2016)データ |
| 1 | 熊本市 | 2,093 |
| 2 | 八代市 | 239 |
| 3 | 天草市 | 130 |
| 4 | 玉名市 | 115 |
| 5 | 人吉市 | 102 |
| 6 | 宇城市 | 92 |
| 6 | 合志市 | 92 |
| 8 | 荒尾市 | 77 |
| 9 | 水俣市 | 76 |
| 10 | 菊池市 | 68 |
| 11 | 菊陽町 | 66 |
| 12 | 山鹿市 | 64 |
| 13 | 宇土市 | 59 |
| 14 | 益城町 | 58 |
| 15 | 大津町 | 56 |
| 16 | 阿蘇市 | 46 |
| 17 | 上天草市 | 30 |
| 18 | 御船町 | 25 |
| 19 | 嘉島町 | 24 |
| 20 | 多良木町 | 23 |
| 21 | 芦北町 | 22 |
| 22 | 山都町 | 21 |
| 23 | 美里町 | 16 |
| 23 | 長洲町 | 16 |
| 23 | 甲佐町 | 16 |
| 26 | 氷川町 | 15 |
| 27 | あさぎり町 | 14 |
| 28 | 苓北町 | 13 |
| 29 | 高森町 | 9 |
| 30 | 小国町 | 8 |
| 30 | 南阿蘇村 | 8 |
| 32 | 錦町 | 7 |
| 33 | 和水町 | 5 |
| 34 | 西原村 | 4 |
| 34 | 湯前町 | 4 |
| 36 | 南関町 | 3 |
| 37 | 南小国町 | 2 |
| 37 | 津奈木町 | 2 |
| 37 | 相良村 | 2 |
| 40 | 玉東町 | 1 |
| 40 | 水上村 | 1 |
| 42 | 産山村 | 0 |
| 42 | 五木村 | 0 |
| 42 | 山江村 | 0 |
| 42 | 球磨村 | 0 |