| 順位 | 市町村名 | 総合・粗付加価値額[百万円](2016)データ |
| 1 | 熊本市 | 163,627 |
| 2 | 合志市 | 110,650 |
| 3 | 菊陽町 | 106,668 |
| 4 | 八代市 | 89,665 |
| 5 | 菊池市 | 64,840 |
| 6 | 大津町 | 63,835 |
| 7 | 宇城市 | 53,693 |
| 8 | 長洲町 | 51,705 |
| 9 | 宇土市 | 47,126 |
| 10 | 益城町 | 36,957 |
| 11 | 山鹿市 | 33,855 |
| 12 | 南関町 | 30,352 |
| 13 | 阿蘇市 | 25,732 |
| 14 | 水俣市 | 21,284 |
| 15 | 玉名市 | 20,989 |
| 16 | 西原村 | 17,735 |
| 17 | 荒尾市 | 17,106 |
| 18 | 天草市 | 9,767 |
| 19 | 人吉市 | 9,431 |
| 20 | 嘉島町 | 9,262 |
| 21 | 和水町 | 8,815 |
| 22 | 芦北町 | 8,099 |
| 23 | あさぎり町 | 5,925 |
| 24 | 錦町 | 5,872 |
| 25 | 甲佐町 | 5,133 |
| 26 | 上天草市 | 4,197 |
| 27 | 御船町 | 3,257 |
| 28 | 玉東町 | 3,116 |
| 29 | 高森町 | 2,382 |
| 30 | 山都町 | 1,886 |
| 31 | 相良村 | 1,779 |
| 32 | 多良木町 | 1,524 |
| 33 | 美里町 | 1,444 |
| 34 | 湯前町 | 1,320 |
| 35 | 苓北町 | 803 |
| 36 | 小国町 | 802 |
| 37 | 津奈木町 | 707 |
| 38 | 南阿蘇村 | 566 |
| 39 | 水上村 | 556 |
| 40 | 球磨村 | 371 |
| 41 | 山江村 | 243 |
| 42 | 南小国町 | 214 |
| 43 | 氷川町 | 208 |