| 順位 | 市町村名 | 製造業[経済センサス2012]=1事業所当たり売上(収入)金額[万円]データ |
| 1 | 西海市 | 203,098 |
| 2 | 諫早市 | 125,115 |
| 3 | 佐々町 | 97,001 |
| 4 | 長崎市 | 80,670 |
| 5 | 大村市 | 58,194 |
| 6 | 時津町 | 54,046 |
| 7 | 松浦市 | 53,108 |
| 8 | 川棚町 | 51,952 |
| 9 | 佐世保市 | 37,066 |
| 10 | 島原市 | 24,360 |
| 11 | 東彼杵町 | 23,262 |
| 12 | 波佐見町 | 21,022 |
| 13 | 雲仙市 | 19,358 |
| 14 | 長与町 | 13,629 |
| 15 | 平戸市 | 8,321 |
| 16 | 壱岐市 | 7,910 |
| 17 | 五島市 | 6,385 |
| 18 | 対馬市 | 4,752 |
| 19 | 南島原市 | 4,322 |
| 20 | 新上五島町 | 3,493 |
| 21 | 小値賀町 | 661 |