| 順位 | 市町村名 | 製造業[経済センサス2012]=1事業所当たり従業者数[人]データ |
| 1 | 佐々町 | 34.0 |
| 2 | 諫早市 | 33.4 |
| 3 | 松浦市 | 29.2 |
| 4 | 西海市 | 29.0 |
| 5 | 時津町 | 28.3 |
| 6 | 大村市 | 27.5 |
| 7 | 川棚町 | 25.9 |
| 8 | 長崎市 | 24.3 |
| 9 | 島原市 | 18.8 |
| 10 | 雲仙市 | 17.6 |
| 11 | 佐世保市 | 17.1 |
| 12 | 東彼杵町 | 15.1 |
| 13 | 長与町 | 12.6 |
| 14 | 平戸市 | 10.3 |
| 15 | 壱岐市 | 7.7 |
| 15 | 波佐見町 | 7.7 |
| 17 | 五島市 | 6.8 |
| 18 | 南島原市 | 5.9 |
| 19 | 対馬市 | 5.1 |
| 19 | 新上五島町 | 5.1 |
| 21 | 小値賀町 | 1.9 |